Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms