Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RarbP22605 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RarbP22605 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RarbP22605 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RarbP22605 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms