Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpcP21841 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms