Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1aP21447 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms