Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms