Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcaP20444 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkcaP20444 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms