Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TP20293 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TP20293 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TP20293 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TP20293 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TP20293 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TP20293 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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