Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P20040 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P20040 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P20040 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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