Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms