Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms