Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs4P18419 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svs4P18419 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Svs4P18419 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms