Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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