Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb1P17919 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb1P17919 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb1P17919 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb1P17919 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb1P17919 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb1P17919 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms