Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PcnaP17918 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PcnaP17918 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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