Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd44P15379 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd44P15379 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms