Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms