Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms