Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DmdP11531 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DmdP11531 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DmdP11531 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DmdP11531 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DmdP11531 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DmdP11531 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DmdP11531 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms