Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fv4P11370 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms