Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP11369 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PolP11369 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PolP11369 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PolP11369 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP11369 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP11369 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP11369 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP11369 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms