Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spp1P10923 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spp1P10923 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms