Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P10404 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P10404 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P10404 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P10404 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P10404 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P10404 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P10404 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
P10404 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms