Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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