Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms