Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calm3P0DP28 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms