Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ly6c1P0CW02 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ly6c1P0CW02 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms