Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NefmP08553 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefmP08553 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefmP08553 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefmP08553 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefmP08553 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefmP08553 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefmP08553 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefmP08553 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefmP08553 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefmP08553 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms