Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms