Protein–RNA interactions for Protein: P06797

Ctsl, Cathepsin L1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtslP06797 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtslP06797 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtslP06797 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtslP06797 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtslP06797 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtslP06797 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms