Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgamP05555 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms