Protein–RNA interactions for Protein: P04219

Putative uncharacterized Ig-region protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04219 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04219 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04219 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04219 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04219 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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P04219 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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P04219 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04219 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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P04219 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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P04219 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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P04219 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04219 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P04219 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms