Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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