Protein–RNA interactions for Protein: P02716

Chrnd, Acetylcholine receptor subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrndP02716 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrndP02716 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms