Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HbaP01942 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HbaP01942 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HbaP01942 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HbaP01942 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HbaP01942 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HbaP01942 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HbaP01942 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HbaP01942 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HbaP01942 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HbaP01942 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HbaP01942 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HbaP01942 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HbaP01942 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HbaP01942 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms