Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Ab1P01921 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms