Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01809 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01809 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01809 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01809 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms