Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01740 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01740 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01740 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01740 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01740 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms