Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01735 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01735 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01735 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01735 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01735 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01735 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01735 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01735 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01735 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01735 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01735 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01735 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01735 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01735 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01735 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01735 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01735 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01735 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01735 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms