Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01679 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01679 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01679 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01679 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01679 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01679 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01679 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01679 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms