Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01678 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01678 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01678 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms