Protein–RNA interactions for Protein: P01671

Ig kappa chain V-III region PC 7175, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01671 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01671 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01671 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01671 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01671 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01671 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01671 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01671 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01671 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01671 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01671 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01671 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms