Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01669 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01669 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01669 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01669 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms