Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01667 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01667 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01667 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms