Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01648 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01648 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01648 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01648 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01648 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01648 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
P01648 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01648 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01648 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01648 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01648 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01648 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01648 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms