Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mtatp6P00848 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms