Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lancl1O89112 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl1O89112 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.9 ms