Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp1O89090 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp1O89090 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms