Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3pxd2aO89032 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms