Protein–RNA interactions for Protein: O88822

Sc5d, Lathosterol oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sc5dO88822 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sc5dO88822 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms