Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BlmO88700 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BlmO88700 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BlmO88700 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BlmO88700 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BlmO88700 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BlmO88700 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BlmO88700 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BlmO88700 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BlmO88700 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BlmO88700 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BlmO88700 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BlmO88700 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BlmO88700 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BlmO88700 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms